생존인가. 소멸인가. 나가레 타쿠마와 야마기시 바쿠는 매립지의 쓰레기 산 위에 서 있었다. 그들의 눈앞에는 하늘에서 추락한 로봇, 겟타 D2 기체가 있었다. 세계는 황폐해져 가고 있었다. 19년 전. 세계는 강력한 적의 공격을 받아 주요 도시들이 괴멸 상태에 빠져버리고 말았다. 각국은 전력을 시베리아에 집중시켜 적과의 결전에 임했다. 나가레 료마 일행이 탄 겟타 로보도 그 가운데에 있었다. 이 '시베리아 전선'의 종결로 인해 세계는 구원받아야 했을 터였다. 하지만... 다시 현재의 일본. 아사마산에 있는 사오토메 연구소에서 진 하야토는 전황을 주시하고 있었다. 새로운 적들과의 싸움이 남모르게 계속되고 있는 상황 속에서, 하야토에게 보고가 들어왔다. 추락한 겟타 D2가 다시 움직였다는 것이었는데, 모니터에 비친 낯선 젊은이는 자신은 나가레 타쿠마라고 말했다. 그때, 겟타 로보와 함께 결전에 임했던 나가레 료마의 아들이었다. 타쿠마는 겟타 D2를 타고 단숨에 상공으로 날아올라 적과의 교전에 들어갔다. 하야토는 대기시켜놓고 있었던 ...